Dworzec w Malborku przeszedł gruntowną renowację i odzyskał dawny blask. Wszystkie prace przebiegały pod ścisłym nadzorem konserwatora zabytków Odnowiono całą elewację, zachowując elementy historyczne, np. ślady strzelaniny z II wojny światowej. Pozostawiono oryginalne zewnętrzne okna, które poddano konserwacji. Odrestaurowano drzwi. Wstawiono nowe okna wewnętrzne.

Dzięki przeprowadzonym pracom konserwatorskim, możemy podziwiać historyczny charakter dworca. Odrestaurowano polichromie - herby w hallu głównym. Podczas konserwacji zabytkowych stropów, usunięto warstwy przemalowań, odsłonięto oryginalne polichromie, zrekonstruowano dekoracje i złocenia, zabezpieczając je jednocześnie lakierem ogniochronnym. Prace konserwatorskie objęły ponadto drewniane elementy muru pruskiego. W sali dawnej restauracji oraz w sali kolumnowej oczyszczono i zrekonstruowano zabytkową boazerię, przywracając jej oryginalną kolorystykę. Odtworzono wszystkie elementy zabytkowe w holu głównym oraz w pomieszczeniach przyległych. Renowacji został poddany także budynek toalety publicznej – również wpisany do rejestru zabytków.
 

Dworzec w Malborku to przykład połączenia historii z nowoczesnością. Dzięki pracom remontowym stał się on bowiem także bardziej funkcjonalny i przyjazny dla podróżnych. Zarówno dworzec, jak i zabytkowy budynek, w którym znajdują się toalety, zostały przystosowane do potrzeb osób niepełnosprawnych. W budynku toalet znajduje się również specjalne pomieszczenie dla matki z dzieckiem. Dla bezpieczeństwa podróżnych na dworcu zainstalowano monitoring. Znajdą się tam także hotel i restauracja.

Podczas remontu wykonano również szereg prac, których nie dostrzegą na pierwszy rzut oka korzystający z dworca pasażerowie. Są one jednak niezbędne, by dworzec mógł sprawnie funkcjonować. Wymieniono między innymi instalacje: sanitarne, energetyczne, teletechniczne. Prac remontowe rozpoczęły się w I kwartale 2010 roku i kosztowały 9 milionów złotych. Wykonawcą było Przedsiębiorstwo Wielobranżowe „EBUD” Przemysłówka Sp. z o.o.